RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276416.10

BIN3-201, Transcript of bridging integrator 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BIN3, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3-201ENST00000276416 NUDCQ9Y266 331 aa22.02■■□□□ 1.12
BIN3-201ENST00000276416 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.01■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 PLEKHG5O94827 1062 aa22.01■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 ABCC6O95255 1503 aa22■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 CPDO75976 1380 aa22■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 HOXC9P31274 260 aa21.99■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 IP6K1Q92551 441 aa21.99■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 COL18A1P39060 1754 aa21.99■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 RGPD5Q99666 1765 aa21.98■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.97■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.97■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 IL13P35225 146 aa21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.96■■□□□ 1.11
BIN3-201ENST00000276416 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.94■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 KIAA0232Q92628 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 JCADQ9P266 1359 aa21.92■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.9■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.9■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
BIN3-201ENST00000276416 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.88■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 FCHSD2O94868 740 aa21.87■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.87■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 HSPA1LP34931 641 aa21.87■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 CHRNA2Q15822 529 aa21.86■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.86■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.86■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 RUNDC1Q96C34 613 aa21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 ERBB3P21860 1342 aa21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 EYA1Q99502 592 aa21.85■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.84■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.83■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.83■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 KDRP35968 1356 aa21.83■■□□□ 1.09
BIN3-201ENST00000276416 FAM83GA6ND36 823 aa21.82■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 HMOX1P09601 288 aa21.82■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.81■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.81■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.81■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NEFMP07197 916 aa21.8■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NCAPD2Q15021 1401 aa21.8■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 PRKAR2BP31323 418 aa21.8■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NGEFQ8N5V2 710 aa21.8■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 NBPF4Q96M43 638 aa21.79■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.78■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 APAF1O14727 1248 aa21.78■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 ADAMTS2O95450 1211 aa21.77■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.77■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.77■■□□□ 1.08
BIN3-201ENST00000276416 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.76■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 NRAPQ86VF7 1730 aa21.75■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 BTG4Q9NY30 223 aa21.75■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.75■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 EVA1CP58658 441 aa21.73■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.73■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 LRP6O75581 1613 aa21.72■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 FBXO41Q8TF61 875 aa21.72■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.72■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 SLIT2O94813 1529 aa21.72■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.71■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 STRN4Q9NRL3 753 aa21.71■■□□□ 1.07
BIN3-201ENST00000276416 CRB1P82279 1406 aa21.7■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.7■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.7■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.7■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 NFE2L2Q16236 605 aa21.69■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.69■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 CCDC27Q2M243 656 aa21.69■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.69■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 NEUROD2Q15784 382 aa21.66■■□□□ 1.06
BIN3-201ENST00000276416 NGLY1Q96IV0 654 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms