RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 NECTIN2Q92692 538 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 CFAP44Q96MT7 982 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.87■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 CDC45O75419 566 aa22.87■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 IL13P35225 146 aa22.85■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 SLC4A2P04920 1241 aa22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LRP3-201ENST00000253193 AMPHP49418 695 aa22.83■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.83■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.82■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.81■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.8■■□□□ 1.24
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LRP3-201ENST00000253193 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.8■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 STK31Q9BXU1 1019 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 ZFYVE9O95405 1425 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 NEO1Q92859 1461 aa22.79■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.78■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 SHPRHQ149N8 1683 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 HMMRO75330 724 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 F6X3S4 739 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 FSD2A1L4K1 749 aa22.77■■□□□ 1.24
LRP3-201ENST00000253193 PPLO60437 1756 aa22.77■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 ZMYM3Q14202 1370 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 MRE11P49959 708 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.75■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 SSFA2P28290 1259 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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LRP3-201ENST00000253193 RILPL2Q969X0 211 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 MEIS3Q99687 375 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.74■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 MCTP1Q6DN14 999 aa22.73■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.73■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 PTPRMP28827 1452 aa22.73■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 ST18O60284 1047 aa22.72■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.72■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 FOXO3O43524 673 aa22.72■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 ACEP12821 1306 aa22.72■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.71■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 SNX21Q969T3 373 aa22.71■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.71■■□□□ 1.23
LRP3-201ENST00000253193 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 METP08581 1390 aa22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 IFT172Q9UG01 1749 aa22.7■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 EID1Q9Y6B2 187 aa22.69■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.69■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 RABEP1Q15276 862 aa22.69■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ABCC4O15439 1325 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 REC8O95072 547 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 DCTPP1Q9H773 170 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 NLRP6P59044 892 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 TTC22Q5TAA0 569 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.67■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 ZNF853P0CG23 659 aa22.67■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 PIK3C2BO00750 1634 aa22.66■■□□□ 1.22
LRP3-201ENST00000253193 SDSP20132 328 aa22.66■■□□□ 1.22
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