RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 SIRT1Q96EB6 747 aa18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 TECPR2O15040 1411 aa18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 MBIPQ9NS73 344 aa18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.98■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 KIF16BQ96L93 1317 aa18.97■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.97■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 BCL11AQ9H165 835 aa18.96■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP10-201ENST00000219473 GNAI1P63096 354 aa18.95■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.95■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 VAMP4O75379 141 aa18.95■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.95■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.94■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 PTPRUQ92729 1446 aa18.94■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.93■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.93■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.92■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 IFT57Q9NWB7 429 aa18.92■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.92■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 MCM10Q7L590 875 aa18.92■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 USP19O94966 1318 aa18.91■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 KRT24Q2M2I5 525 aa18.91■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 ITSN1Q15811 1721 aa18.91■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 CFAP44Q96MT7 982 aa18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
USP10-201ENST00000219473 LNPKQ9C0E8 428 aa18.89■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 USP6P35125 1406 aa18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 ZNF853P0CG23 659 aa18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 C3P01024 1663 aa18.88■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 C14orf37Q86TY3 774 aa18.87■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.87■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 AKAP12Q02952 1782 aa18.86■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 KCNA6P17658 529 aa18.86■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.86■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 FOXO3O43524 673 aa18.85■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 AMPHP49418 695 aa18.85■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 TBX22Q9Y458 520 aa18.85■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 PLEKHG5O94827 1062 aa18.85■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.85■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 NLRP6P59044 892 aa18.84■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 ZNF428Q96B54 188 aa18.84■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 SMC5Q8IY18 1101 aa18.84■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.83■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.83■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
USP10-201ENST00000219473 NFKBIBQ15653 356 aa18.83■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.82■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.8■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.79■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.79■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.78■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.78■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 NUCB1Q02818 461 aa18.78■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 BECN1Q14457 450 aa18.77■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 ABTB2Q8N961 1025 aa18.77■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 EYA1Q99502 592 aa18.77■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.77■□□□□ 0.6
USP10-201ENST00000219473 PEAK1Q9H792 1746 aa18.77■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.77■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 USP35Q9P2H5 1018 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 ABCC4O15439 1325 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 CHL1O00533 1208 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 USP31Q70CQ4 1352 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.76■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 PTCH1Q13635 1447 aa18.75■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.75■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.75■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 SLIT1O75093 1534 aa18.75■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 DIP2AQ14689 1571 aa18.75■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 FLT4P35916 1363 aa18.74■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.74■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.74■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 SSH2Q76I76 1423 aa18.74■□□□□ 0.59
USP10-201ENST00000219473 APBB1O00213 710 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms