RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SSX5O60225 188 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL1AP01583 271 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 HIST1H2ABP04908 130 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 GLI1P08151 1106 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MMP2P08253 660 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 HOXB5P09067 269 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PEPDP12955 493 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 LYL1P12980 280 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ETS1P14921 441 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ITIH1P19827 911 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 HIST1H2ADP20671 130 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 DRD4P21917 467 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MATN1P21941 496 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 IL4RP24394 825 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDAP32320 146 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 GJC1P36383 396 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 RABIFP47224 123 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FASLGP48023 281 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CAMLGP49069 296 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NDUFV1P49821 464 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 BLKP51451 505 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF75DP51815 510 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 RRADP55042 308 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTAPQ13126 283 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FHL3Q13643 280 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRT33BQ14525 404 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 BOLA3Q53S33 107 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM91A1Q658Y4 838 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CASC4Q6P4E1 433 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 DET1Q7L5Y6 550 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MMP21Q8N119 569 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SVOPQ8N4V2 548 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 KYQ8NBH2 561 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FLAD1Q8NFF5 587 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 TP53INP1Q96A56 240 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARSGQ96EG1 525 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM84AQ96KN4 292 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NEK1Q96PY6 1258 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 INTS14Q96SY0 518 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 TCF25Q9BQ70 676 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 INPP5KQ9BT40 448 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 IKZF4Q9H2S9 585 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 USP29Q9HBJ7 922 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNX6Q9UNH7 406 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A1W2PQF6 199 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 CTAGE15A4D2H0 777 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM247A6NEH6 219 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRIM24O15164 1050 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 VEGFDO43915 354 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLCO2B1O94956 709 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 NKX2-2O95096 273 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-347P-201ENST00000516658 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms