RNA–Protein interactions for RNA: YOR168W

GLN4, Transcript of Glutamine tRNA synthetase, yeast

Gene GLN4, Length 2,430 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GLN4	YOR168W	SSH4	P32343	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	RRN3	P36070	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	ESL1	P40456	1118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	TAF1	P46677	1066 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	GPI8	P49018	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	SCY1	P53009	804 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	CYB2	P00175	591 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	SAM37	P50110	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	YNL058C	P53947	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	INH1	P01097	85 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	GAL1	P04385	528 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
GLN4	YOR168W	PLC1	P32383	869 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	ANP1	P32629	500 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	MET14	Q02196	202 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	TFB2	Q02939	513 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GLN4	YOR168W	BRF1	P29056	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	EUG1	P32474	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	RTA1	P53047	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TUB4	P53378	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YML131W	Q03102	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PHM6	Q05637	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	VAN1	P23642	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SLI15	P38283	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PFD1	P46988	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YGR016W	P53209	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	CDC55	Q00362	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	UBP1	P25037	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SOH1	P38633	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TGL3	P40308	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	BFA1	P47113	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PMT3	P47190	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	UFD2	P54860	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	REH1	Q06709	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	THI73	Q07904	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	IMP2'	P32351	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	JNM1	P36224	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PEX14	P53112	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	UGO1	Q03327	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TRS33	Q99394	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YBR197C	P38306	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YNL115C	P53925	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	UME1	Q03010	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TAF8	Q03750	510 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	CDC45	Q08032	650 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	STR2	P47164	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	UBA2	P52488	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MED1	Q12321	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SFP1	P32432	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HSP78	P33416	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	BET3	P36149	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MNT3	P40549	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HLJ1	P48353	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YNL011C	P53980	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	EEB1	Q02891	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SDH5	Q08230	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	SSP2	Q08646	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	TFB4	Q12004	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MSB4	Q12317	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PPH3	P32345	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	MKK2	P32491	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PUS6	P53294	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YNL193W	P53870	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	CAB1	Q04430	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	FMP25	Q08023	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	HSP42	Q12329	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
GLN4	YOR168W	MCM10	P32354	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	YHL008C	P38750	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GLN4	YOR168W	NUP145	P49687	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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