RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W GAS5Q08193 484 aa3.62□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W SMY1P32364 656 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W MOB1P40484 314 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.61□□□□□ -1.83not detected
SIN3YOL004W POL5P39985 1022 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W JJJ2P46997 583 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W KIN4Q01919 800 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W IRC10Q08118 586 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W RMD1Q03441 430 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W NSE1Q07913 336 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W SFP1P32432 683 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W PKH1Q03407 766 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W YOL024WQ08172 172 aa3.61□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W SEG2P34250 1132 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W PEX19Q07418 342 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W TY1B-BRQ12193 1756 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W TY1B-ORQ92393 1755 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W GYP8P43570 497 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W HAT1Q12341 374 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W NUP145P49687 1317 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W ERG12P07277 443 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W PDI1P17967 522 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W YCL042WP25572 119 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W CPS1P27614 576 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W GPB2P39717 880 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W BUD16P39988 312 aa3.6□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W DAL5P15365 543 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W BET2P20133 325 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W GRX4P32642 244 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W BBC1P47068 1157 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W LDB19Q12502 818 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
SIN3YOL004W KTR4P38131 464 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W MUM2P38236 366 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W CDC73Q06697 393 aa3.59□□□□□ -1.83
SIN3YOL004W TAO3P40468 2376 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W ASF1P32447 279 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W VID27P40157 782 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W IML2P47031 731 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PHM7Q12252 991 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PPX1P38698 397 aa3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SET2P46995 733 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SVF1Q05515 481 aa3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PPH3P32345 308 aa3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W CDC3P32457 520 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W RTG3P38165 486 aa3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W HRQ1Q05549 1077 aa3.57□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W NTH2P35172 780 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W HEM3P28789 327 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PNT1P38969 423 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W LSB6P42951 607 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W CDA2Q06703 312 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W NSE3Q05541 303 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W VPS72Q03388 795 aa3.56□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SRC1Q03707 834 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W RXT2P38255 430 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W HXT15P54854 567 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W YRR1Q12172 810 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W DPH6Q12429 685 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PTC3P34221 468 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W ULI1P43604 169 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W CAF120P53836 1060 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W EUG1P32474 517 aa3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W SAH1P39954 449 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W RCM1P53972 490 aa3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W DPS1P04802 557 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W HSP104P31539 908 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W RTS3P53289 263 aa3.54□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W TFB3Q03290 321 aa3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W AI2P03876 854 aa3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W VPS4P52917 437 aa3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SIN3YOL004W HMG2P12684 1045 aa3.53□□□□□ -1.84
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