RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	YJR107W	P47145	328 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	GAS5	Q08193	484 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	RAD53	P22216	821 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	CLB5	P30283	435 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	PNT1	P38969	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	IRC8	P47046	822 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	TPM2	P40414	161 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	YOR131C	Q12486	218 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	VPS45	P38932	577 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	IOC3	P43596	787 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FKS3	YMR306W	VPS8	P39702	1274 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YIR042C	P40586	236 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SOL4	P53315	255 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	ISW2	Q08773	1120 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	ALG2	P43636	503 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SPO1	P53541	631 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	FMP30	Q02883	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PKC1	P24583	1151 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MSC7	P38694	644 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SET4	P42948	560 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	LSB1	P53281	241 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MAM3	Q12296	706 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YGR122W	P53272	402 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YNL193W	P53870	558 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	ICL2	Q12031	575 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SEC8	P32855	1065 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SPL2	P38839	148 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	VPS62	P53285	467 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	TOS4	Q06266	489 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
FKS3	YMR306W	RKM4	Q12504	494 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	ULP1	Q02724	621 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	LAP2	Q10740	671 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RTS1	P38903	757 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MXR1	P40029	184 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MTC3	P53077	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	TAH18	Q12181	623 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PMD1	P32634	1753 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	EUG1	P32474	517 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RGT1	P32862	1170 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	GPB2	P39717	880 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YGL242C	P53066	181 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SLA1	P32790	1244 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	TIM23	P32897	222 aa		3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	DIT2	P21595	489 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	LEO1	P38439	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	IXR1	P33417	597 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YJL007C	P47080	104 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PPM2	Q08282	695 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YLL058W	Q12198	575 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	KIN1	P13185	1064 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SNA3	P14359	133 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SRM1	P21827	482 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PRE8	P23639	250 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YIL092W	P40497	633 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YJL171C	P46992	396 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YGR125W	P53273	1036 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RTP1	Q12751	981 aa		2.99	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
FKS3	YMR306W	AFT1	P22149	690 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	RAD61	Q99359	647 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	IRE1	P32361	1115 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SAS3	P34218	831 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	MET1	P36150	593 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	SLD5	Q03406	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	YML037C	Q03703	340 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
FKS3	YMR306W	UFD2	P54860	961 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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