RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	FUS1	P11710	512 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	PPX1	P38698	397 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	YHL008C	P38750	627 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	ALD3	P54114	506 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	NHA1	Q99271	985 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	SEC20	P28791	383 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	TFA2	P36145	328 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	CTR9	P89105	1077 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	COB	P00163	385 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	TED1	P40533	473 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RSM27	YGR215W	MET4	P32389	672 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	GIP2	P40036	548 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	YJR124C	P47159	448 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	PHM7	Q12252	991 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	FLP1	P03870	423 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	DUR3	P33413	735 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	ICP55	P40051	511 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	NEO1	P40527	1151 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	LSB6	P42951	607 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	SAM37	P50110	327 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	MON1	P53129	644 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	GLO4	Q12320	285 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	RRM3	P38766	723 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	PRY1	P47032	299 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	YMR187C	Q03236	431 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	GAS5	Q08193	484 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	SOG2	Q08817	791 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	PAN5	P38787	379 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	SLP1	Q12232	587 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RSM27	YGR215W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	DAK2	P43550	591 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	GUP1	P53154	560 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	NPR1	P22211	790 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	FET4	P40988	552 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	POL32	P47110	350 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	NUT1	P53114	1132 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	YDR215C	Q12240	137 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	RIM11	P38615	370 aa		6.19	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	HVG1	P0CE11	249 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	SAC7	P17121	654 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	VPS35	P34110	944 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	BUD9	P53226	547 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	MSH6	Q03834	1242 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	DAL4	Q04895	635 aa		6.18	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	ATE1	P16639	503 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	HEM3	P28789	327 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	TAT1	P38085	619 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	SPO71	Q03868	1245 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	YCS4	Q06156	1176 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	TOS4	Q06266	489 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	MCA1	Q08601	432 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	OXR1	Q08952	273 aa		6.17	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	UGA4	P32837	571 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	LEM3	P42838	414 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	PMT7	Q06644	662 aa		6.16	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	YAF9	P53930	226 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	RGA2	Q06407	1009 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RSM27	YGR215W	ERS1	P17261	260 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	MGE1	P38523	228 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	SKN7	P38889	622 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	DSE4	P53753	1117 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	YMR074C	Q04773	145 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	ELG1	Q12050	791 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	FAA3	P39002	694 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	SAP155	P43612	1002 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	AI3	P03877	415 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	MCM2	P29469	868 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	RSM26	P47141	266 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	ULP1	Q02724	621 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	MTC5	Q03897	1148 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RSM27	YGR215W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43

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