RNA–Protein interactions for RNA: YGR133W

PEX4, Transcript of Peroxisomal ubiquitin conjugating enzyme, yeast

Gene PEX4, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX4	YGR133W	DFG16	Q99234	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	TAF1	P46677	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	GUP1	P53154	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	GIC2	Q06648	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	TRS33	Q99394	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	ERS1	P17261	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	ALD3	P54114	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	SOG2	Q08817	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	ELG1	Q12050	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX4	YGR133W	MSN1	P22148	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	YBR197C	P38306	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	YHL008C	P38750	627 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	LEM3	P42838	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	GIP4	P39732	760 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	CDA2	Q06703	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	ISC10	P32645	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	NEO1	P40527	1151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	ECM23	Q02710	187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	FUS1	P11710	512 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX4	YGR133W	HSP78	P33416	811 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	SIS2	P36024	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	MMM1	P41800	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	GIS1	Q03833	894 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	TGL4	P36165	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	AIM46	P38885	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	UBX7	P38349	436 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	YJR124C	P47159	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	THI80	P35202	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	CIT3	P43635	486 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	NSI1	Q12457	570 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	GPT2	P36148	743 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	FIR1	P40020	876 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	RCM1	P53972	490 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX4	YGR133W	HXT8	P40886	569 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	RGD2	P43556	714 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	FAR11	P53917	953 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	FLR1	P38124	548 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	YBR287W	P38355	427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	GLO4	Q12320	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	PUN1	Q06991	263 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	KTR2	P33550	425 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	FET4	P40988	552 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	HDA2	Q06629	674 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	TTI1	P36097	1038 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PEX4	YGR133W	ADP1	P25371	1049 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	NTA1	P40354	457 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	SSY1	Q03770	852 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	EAR1	Q03212	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	RAD55	P38953	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	ORC3	P54790	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	TRE1	Q08919	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	SRS2	P12954	1174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	RPB10	P22139	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	PSY2	P40164	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	INO80	P53115	1489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	PRO1	P32264	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PEX4	YGR133W	PUP1	P25043	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	CPS1	P27614	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	PEX7	P39108	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	MRPL22	P53881	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	APC11	Q12157	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	ALT1	P52893	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	GCV1	P48015	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	RIM8	P53179	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	YVC1	Q12324	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PEX4	YGR133W	PTC7	P38797	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.3 ms