RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PRI2	P20457	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NFU1	P32860	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	TAT2	P38967	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	MEH1	Q02205	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	OPI1	P21957	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	VAC17	P25591	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	MAL31	P38156	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PAF1	P38351	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NUP85	P46673	744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YGR021W	P53212	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NYV1	Q12255	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	DAL5	P15365	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	CDC11	P32458	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	MNR2	P35724	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	ACO2	P39533	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	VID27	P40157	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	TMA17	Q12513	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	MTC2	P34246	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
SLX8	YER116C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	HIR1	P32479	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YAP1801	P38856	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	NIT1	P40447	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SND1	Q04007	877 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	OPT2	Q06593	877 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ARG82	P07250	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	CYC8	P14922	966 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	VAN1	P23642	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SOH1	P38633	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	HOS4	P40480	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SPR3	P41901	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YJR120W	P47157	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	GAS4	Q08271	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	NHA1	Q99271	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TAF13	P11747	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SFP1	P32432	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TFC3	P34111	1160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YBL086C	P38177	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TYW3	P53177	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YGR122W	P53272	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	FLC1	Q08967	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TRS33	Q99394	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	INH1	P01097	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	PIF1	P07271	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YKL222C	P35995	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	IES5	P40060	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ATG3	P40344	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SAM37	P50110	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SCW11	P53189	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	TSC13	Q99190	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	CIT1	P00890	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	ATP4	P05626	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SWI3	P32591	825 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YHL008C	P38750	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	AAD14	P42884	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	HLJ1	P48353	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YGR237C	P50089	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	LSC2	P53312	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	CAF120	P53836	1060 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	OPI10	Q08202	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	NTG2	Q08214	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	OXR1	Q08952	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	REC8	Q12188	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	FOB1	O13329	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	CYT1	P07143	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	SUV3	P32580	737 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX8	YER116C	VPS35	P34110	944 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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