RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POP4YBR257W NAM7P30771 971 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POP4YBR257W NTA1P40354 457 aa7.18□□□□□ -1.26
POP4YBR257W COQ2P32378 372 aa7.17□□□□□ -1.26
POP4YBR257W HVG1P0CE11 249 aa7.16□□□□□ -1.26
POP4YBR257W AKR1P39010 764 aa7.16□□□□□ -1.26
POP4YBR257W POL5P39985 1022 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
POP4YBR257W DSE4P53753 1117 aa7.16□□□□□ -1.26
POP4YBR257W KAE1P36132 386 aa7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W SAF1P38352 637 aa7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W FIR1P40020 876 aa7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W CTH1P47976 325 aa7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W GUP1P53154 560 aa7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
POP4YBR257W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data7.15□□□□□ -1.26not detected
POP4YBR257W RAD55P38953 406 aa7.14□□□□□ -1.27
POP4YBR257W RRN6P32786 894 aa7.13□□□□□ -1.27
POP4YBR257W PSY2P40164 858 aa7.13□□□□□ -1.27
POP4YBR257W YJR124CP47159 448 aa7.12□□□□□ -1.27
POP4YBR257W NCE103P53615 221 aa7.12□□□□□ -1.27
POP4YBR257W YNR065CP53751 1116 aa7.12□□□□□ -1.27
POP4YBR257W MED7Q08278 222 aa7.12□□□□□ -1.27
POP4YBR257W GLO4Q12320 285 aa7.12□□□□□ -1.27
POP4YBR257W ERS1P17261 260 aa7.11□□□□□ -1.27
POP4YBR257W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POP4YBR257W TOS1P38288 455 aa7.11□□□□□ -1.27
POP4YBR257W YGR130CP53278 816 aa7.11□□□□□ -1.27
POP4YBR257W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POP4YBR257W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POP4YBR257W CTR9P89105 1077 aa7.1□□□□□ -1.27
POP4YBR257W COBP00163 385 aa7.09□□□□□ -1.27
POP4YBR257W SEA4P38164 1038 aa7.09□□□□□ -1.27
POP4YBR257W ELG1Q12050 791 aa7.09□□□□□ -1.27
POP4YBR257W LEM3P42838 414 aa7.08□□□□□ -1.28
POP4YBR257W SMC1P32908 1225 aa7.07□□□□□ -1.28
POP4YBR257W YBR287WP38355 427 aa7.07□□□□□ -1.28
POP4YBR257W NEO1P40527 1151 aa7.07□□□□□ -1.28
POP4YBR257W SPO71Q03868 1245 aa7.07□□□□□ -1.28
POP4YBR257W TAF7Q05021 590 aa7.07□□□□□ -1.28
POP4YBR257W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POP4YBR257W FUR4P05316 633 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POP4YBR257W CHS2P14180 963 aa7.06□□□□□ -1.28
POP4YBR257W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data7.06□□□□□ -1.28not detected
POP4YBR257W MAE1P36013 669 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POP4YBR257W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
POP4YBR257W KIP3P53086 805 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
POP4YBR257W BRE4Q07660 1125 aa7.05□□□□□ -1.28
POP4YBR257W LIP5P32875 414 aa7.04□□□□□ -1.28
POP4YBR257W DUR3P33413 735 aa7.04□□□□□ -1.28
POP4YBR257W SPO74P45819 413 aa7.04□□□□□ -1.28
POP4YBR257W CYC7P00045 113 aa7.02□□□□□ -1.29
POP4YBR257W AVT1P47082 602 aa7.02□□□□□ -1.29
POP4YBR257W FET4P40988 552 aa7.01□□□□□ -1.29
POP4YBR257W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
POP4YBR257W IRC24P40580 263 aa7□□□□□ -1.29
POP4YBR257W RLF2Q12495 606 aa7□□□□□ -1.29
POP4YBR257W RIM11P38615 370 aa6.99□□□□□ -1.29
POP4YBR257W QDR1P40475 563 aa6.99□□□□□ -1.29
POP4YBR257W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
POP4YBR257W SDH1Q00711 640 aa6.98□□□□□ -1.29
POP4YBR257W RSC4Q02206 625 aa6.98□□□□□ -1.29
POP4YBR257W KAR5Q04746 504 aa6.98□□□□□ -1.29
POP4YBR257W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
POP4YBR257W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
POP4YBR257W MNL2Q12205 849 aa6.97□□□□□ -1.29
POP4YBR257W ATG1P53104 897 aa6.96□□□□□ -1.3
POP4YBR257W GIC2Q06648 383 aa6.95□□□□□ -1.3
POP4YBR257W SGS1P35187 1447 aa6.94□□□□□ -1.3
POP4YBR257W NPR1P22211 790 aa6.94□□□□□ -1.3
POP4YBR257W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W ELM1P32801 640 aa6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W GPT2P36148 743 aa6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W UFD2P54860 961 aa6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W YIG1Q08956 461 aa6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W YOR223WQ12015 292 aa6.93□□□□□ -1.3
POP4YBR257W WHI3P34761 661 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
POP4YBR257W FAR11P53917 953 aa6.92□□□□□ -1.3
POP4YBR257W MSH6Q03834 1242 aa6.92□□□□□ -1.3
POP4YBR257W AOS1Q06624 347 aa6.92□□□□□ -1.3
POP4YBR257W TRL1P09880 827 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
POP4YBR257W LRG1P35688 1017 aa6.91□□□□□ -1.3
POP4YBR257W HTS1P07263 546 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
POP4YBR257W TRS120Q04183 1289 aa6.9□□□□□ -1.3
POP4YBR257W YMR074CQ04773 145 aa6.9□□□□□ -1.3
POP4YBR257W GCV1P48015 400 aa6.89□□□□□ -1.31
POP4YBR257W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
POP4YBR257W SSN2P38931 1420 aa6.89□□□□□ -1.31
POP4YBR257W SAP155P43612 1002 aa6.88□□□□□ -1.31
POP4YBR257W ACF4P47129 309 aa6.88□□□□□ -1.31
POP4YBR257W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-DR6P0CX70 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-ER1P0CX71 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-LR2P0CX72 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-PLP0CX73 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-JR1P0CX74 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-LR3P0CX75 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W TY1A-ML2P0CX76 440 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W MMM1P41800 426 aa6.87□□□□□ -1.31
POP4YBR257W GPI13Q07830 1017 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 71.3 ms