RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 JUNDP17535 347 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 RETREG2Q8NC44 543 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 UCN2Q96RP3 112 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.11□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PIK3CDO00329 1044 aa4.1□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.1□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 MTRQ99707 1265 aa4.1□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 ZPR1O75312 459 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 DXOO77932 396 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNH2Q12809 1159 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 NR1H3Q13133 447 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPRNQ16849 979 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 PNMA1Q8ND90 353 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.09□□□□□ -1.75
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBBXA8MT70 800 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 MMP16P51512 607 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.08□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 MSS51Q4VC12 460 aa4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 CEP126Q9P2H0 1117 aa4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 SKIP12755 728 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX11P35716 441 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PTK2Q05397 1052 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 BAP1Q92560 729 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.06□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP9BO43861 1147 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 S1PR4O95977 384 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ADH1BP00325 375 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEGQ6S5H5 508 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAM32Q8TC27 787 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 FOXJ1Q92949 421 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.05□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01559Q495D7 138 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB33Q86T24 672 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 IL21Q9HBE4 155 aa4.04□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 AGERQ15109 404 aa4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPTAN1-232ENST00000636483 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L3A6NCW0 530 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L4A6NCW7 530 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L5A8MUK1 530 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 ATG7O95352 703 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 NCOA4Q13772 614 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF135Q8IUD6 432 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 GPSM3Q9Y4H4 160 aa4.02□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3BP2P78314 561 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF14Q5TI25 921 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 STK32AQ8WU08 396 aa4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 LGR5O75473 907 aa4□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 RASA1P20936 1047 aa4□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 ERFEQ4G0M1 354 aa4□□□□□ -1.77
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF511Q8NB15 262 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms