RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629343.2

TCF4-267, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-267	ENST00000629343	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	USP6	P35125	1406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	PANK3	Q9H999	370 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343		A0A1W2PP64	1363 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	FYB1	O15117	783 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	NLRP6	P59044	892 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TCF4-267	ENST00000629343	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	NME9	Q86XW9	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	GC	P02774	474 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	USP19	O94966	1318 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	LRP6	O75581	1613 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TCF4-267	ENST00000629343	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	FBLN1	P23142	703 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	C8orf37	Q96NL8	207 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	COG3	Q96JB2	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	CPD	O75976	1380 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	AFF2	P51816	1311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TCF4-267	ENST00000629343	SOX12	O15370	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	USP21	Q9UK80	565 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	MYOM1	P52179	1685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	SLIT3	O75094	1523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	SLIT2	O94813	1529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	IP6K1	Q92551	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	VPS72	Q15906	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	EVA1C	P58658	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TCF4-267	ENST00000629343	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	NSD2	O96028	1365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	NFAT5	O94916	1531 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	HOXC9	P31274	260 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-267	ENST00000629343	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25

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