RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP5O75197 1615 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP7BP35670 1465 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JS52 829 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 MYT1Q01538 1121 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM182BQ5T319 152 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 STAC3Q96MF2 364 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 BAG6P46379 1132 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ITSN1Q15811 1721 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD1P0DJD0 1748 aa35.01■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 DISP2A7MBM2 1401 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0232Q92628 1395 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA2Q15822 529 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK19Q9BWU1 502 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-216ENST00000628306 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ACEP12821 1306 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 STRN4Q9NRL3 753 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SSH2Q76I76 1423 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-216ENST00000628306 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 USP19O94966 1318 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM37O94972 964 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 BARGINQ6ZT62 677 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CPDO75976 1380 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-216ENST00000628306 USP35Q9P2H5 1018 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RREB1Q92766 1687 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ABTB2Q8N961 1025 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.7■■■■□ 3.15
CAPNS1-216ENST00000628306 APBA3O96018 575 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 EVA1CP58658 441 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GCP02774 474 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE3BQ13370 1112 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CABP2Q9NPB3 220 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP13Q86W25 1043 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SLIT3O75094 1523 aa34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PEAK1Q9H792 1746 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 USP6P35125 1406 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-216ENST00000628306 COL18A1P39060 1754 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CRB1P82279 1406 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CABP1Q9NZU7 370 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3C2AO00443 1686 aa34.53■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC37A3O60309 1634 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP6P59044 892 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SBF2Q86WG5 1849 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.46■■■■□ 3.11
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.44■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF14Q5TI25 921 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms