RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 ATP7BP35670 1465 aa36.34■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.32■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 CDK19Q9BWU1 502 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 ITSN1Q15811 1721 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JS52 829 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 MYT1Q01538 1121 aa36.28■■■■□ 3.4
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.23■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.21■■■■□ 3.39
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0232Q92628 1395 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 ACEP12821 1306 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.18■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.16■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA2Q15822 529 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPRF-216ENST00000617451 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 BAG6P46379 1132 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 FAM182BQ5T319 152 aa36.1■■■■□ 3.37
PTPRF-216ENST00000617451 ABTB2Q8N961 1025 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 STRN4Q9NRL3 753 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 USP19O94966 1318 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 CABP2Q9NPB3 220 aa36.01■■■■□ 3.36
PTPRF-216ENST00000617451 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.01■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 CPDO75976 1380 aa36■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 EVA1CP58658 441 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 SSH2Q76I76 1423 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP13Q86W25 1043 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 USP35Q9P2H5 1018 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 DISP2A7MBM2 1401 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 BARGINQ6ZT62 677 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.95■■■■□ 3.35
PTPRF-216ENST00000617451 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 GCP02774 474 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 LRP5O75197 1615 aa35.91■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 CABP1Q9NZU7 370 aa35.91■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM37O94972 964 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRF-216ENST00000617451 USP6P35125 1406 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 PDE3BQ13370 1112 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP6P59044 892 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 EVC2Q86UK5 1308 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRF-216ENST00000617451 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 APBA3O96018 575 aa35.81■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 SLIT3O75094 1523 aa35.78■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.78■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.77■■■■□ 3.32
PTPRF-216ENST00000617451 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 CRB1P82279 1406 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 NEUROD1Q13562 356 aa35.75■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3C2AO00443 1686 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
PTPRF-216ENST00000617451 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 COL18A1P39060 1754 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.65■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 RREB1Q92766 1687 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRF-216ENST00000617451 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.63■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP12Q02952 1782 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRF-216ENST00000617451 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.61■■■■□ 3.29
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