RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592099.5

PTPRS-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-210ENST00000592099 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRS-210ENST00000592099 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRS-210ENST00000592099 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRS-210ENST00000592099 KIAA0556O60303 1618 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRS-210ENST00000592099 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 NFKBIBQ15653 356 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CDC45O75419 566 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 ABTB2Q8N961 1025 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 VPS53Q5VIR6 699 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 VPS37DQ86XT2 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 PLCH2O75038 1416 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 NOS1P29475 1434 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 FCHSD2O94868 740 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TPM1P09493 284 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 MSH5O43196 834 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 DISP1Q96F81 1524 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TESK2Q96S53 571 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 CEP89Q96ST8 783 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 BICD2Q8TD16 824 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-210ENST00000592099 ERICH2A1L162 156 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 SLC4A2P04920 1241 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 TPM2P07951 284 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ARID3AQ99856 593 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 PZPP20742 1482 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 GCC1Q96CN9 775 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 CNTROBQ8N137 903 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NFE2L2Q16236 605 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 WASHC4Q2M389 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 PSMA5P28066 241 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NME9Q86XW9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 GNAI2P04899 355 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 FSD1Q9BTV5 496 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 DCTN1Q14203 1278 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 MCM2P49736 904 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-210ENST00000592099 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms