RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.862e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2-218ENST00000590367 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 USP47Q96K76 1375 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPA1LP34931 641 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 HS1BP3Q53T59 392 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 STRCQ7RTU9 1775 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MROH2AA6NES4 1674 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 WWC1Q8IX03 1113 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 E9PSI1 815 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 CNPY4Q8N129 248 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 CBX1P83916 185 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MCM5P33992 734 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE3BQ13370 1112 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 C8orf34Q49A92 452 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM193AP78312 1265 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNJ4P48050 445 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MMP14P50281 582 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNA6P17658 529 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 YY1AP1Q9H869 796 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF3AQ9Y496 699 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 TIGD1Q96MW7 591 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP152O94986 1710 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM94Q12767 1356 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 ATF3P18847 181 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRL2O95490 1459 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 RALBP1Q15311 655 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 GBP4Q96PP9 640 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 ILDR2Q71H61 639 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CRBNQ96SW2 442 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 MSH6P52701 1360 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 NOS1P29475 1434 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 STK26Q9P289 416 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO3Q9UK99 471 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 TBX22Q9Y458 520 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-218ENST00000590367 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 EFCC1Q9HA90 598 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CPS1P31327 1500 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 SLAIN2Q9P270 581 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBTB22O15209 634 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 FEZ1Q99689 392 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 TMF1P82094 1093 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 MED14O60244 1454 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 NUTM2FA1L443 756 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-218ENST00000590367 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms