RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 CABP1Q9NZU7 370 aa28.21■■■□□ 2.11
EFTUD2-217ENST00000590124 SLIT2O94813 1529 aa28.2■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 RXRBP28702 533 aa28.2■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHG5O94827 1062 aa28.18■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 ATRNO75882 1429 aa28.18■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.17■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 USP6P35125 1406 aa28.16■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.16■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 AKAP12Q02952 1782 aa28.14■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 TESK2Q96S53 571 aa28.14■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.14■■■□□ 2.1
EFTUD2-217ENST00000590124 SSH2Q76I76 1423 aa28.13■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.13■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM83GA6ND36 823 aa28.11■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.1■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 USP47Q96K76 1375 aa28.1■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 RGS12O14924 1447 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.09■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 ABTB2Q8N961 1025 aa28.08■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
EFTUD2-217ENST00000590124 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 USP19O94966 1318 aa28.07■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 NRAPQ86VF7 1730 aa28.06■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.06■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 PIK3C2AO00443 1686 aa28.05■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.05■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 GLI3P10071 1580 aa28.03■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC24A1O60721 1099 aa28.03■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 NLRP13Q86W25 1043 aa28.02■■■□□ 2.08
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA0232Q92628 1395 aa28.01■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 VPS72Q15906 364 aa28■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 SLIT3O75094 1523 aa27.99■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.99■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.99■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 BTG4Q9NY30 223 aa27.99■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 CPDO75976 1380 aa27.98■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.97■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 NLRP6P59044 892 aa27.97■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 TMC1Q8TDI8 760 aa27.97■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 GCP02774 474 aa27.96■■■□□ 2.07
EFTUD2-217ENST00000590124 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.95■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.94■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 CHRNA2Q15822 529 aa27.94■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 TMF1P82094 1093 aa27.93■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 USP54Q70EL1 1684 aa27.92■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PP64 1363 aa27.92■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.91■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.89■■■□□ 2.06
EFTUD2-217ENST00000590124 USP31Q70CQ4 1352 aa27.88■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.86■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.86■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.85■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 NFAT5O94916 1531 aa27.85■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 COL18A1P39060 1754 aa27.85■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 CDCA8Q53HL2 280 aa27.84■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 NME9Q86XW9 330 aa27.84■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.84■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.83■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.83■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.83■■■□□ 2.05
EFTUD2-217ENST00000590124 MYOM1P52179 1685 aa27.82■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.82■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 STRN4Q9NRL3 753 aa27.81■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.8■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.8■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.79■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.78■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.78■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 EVA1CP58658 441 aa27.77■■■□□ 2.04
EFTUD2-217ENST00000590124 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
EFTUD2-217ENST00000590124 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.75■■■□□ 2.03
EFTUD2-217ENST00000590124 SOX12O15370 315 aa27.75■■■□□ 2.03
EFTUD2-217ENST00000590124 RGPD5Q99666 1765 aa27.74■■■□□ 2.03
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC6O95255 1503 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms