RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
EFTUD2-215ENST00000589825 ATRNO75882 1429 aa22.82■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCA3Q99758 1704 aa22.82■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.82■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.81■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CABP1Q9NZU7 370 aa22.8■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 SLIT2O94813 1529 aa22.8■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 RGS12O14924 1447 aa22.8■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 ABTB2Q8N961 1025 aa22.79■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.78■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM83GA6ND36 823 aa22.77■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.77■■□□□ 1.24
EFTUD2-215ENST00000589825 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.76■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.75■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 VPS72Q15906 364 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 NLRP13Q86W25 1043 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 BTG4Q9NY30 223 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.71■■□□□ 1.23
EFTUD2-215ENST00000589825 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 USP6P35125 1406 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC24A1O60721 1099 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA0232Q92628 1395 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NLRP6P59044 892 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TMC1Q8TDI8 760 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 GLI3P10071 1580 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A0G2JS52 829 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MYT1Q01538 1121 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CHRNA2Q15822 529 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 USP19O94966 1318 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 NRAPQ86VF7 1730 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 GCP02774 474 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 EVA1CP58658 441 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 AKAP12Q02952 1782 aa22.63■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 STRN4Q9NRL3 753 aa22.62■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.61■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.61■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.61■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.61■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 SSH2Q76I76 1423 aa22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 CPDO75976 1380 aa22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 USP47Q96K76 1375 aa22.59■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TESK2Q96S53 571 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3C2AO00443 1686 aa22.57■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 TMF1P82094 1093 aa22.56■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.28e-7■■□□□ 12.8
EFTUD2-215ENST00000589825 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.55■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.55■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.55■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC125Q86Z20 511 aa22.55■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.53■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SLIT3O75094 1523 aa22.53■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SOX12O15370 315 aa22.53■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 USP35Q9P2H5 1018 aa22.53■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.53■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 CDCA8Q53HL2 280 aa22.52■■□□□ 1.2
EFTUD2-215ENST00000589825 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.51■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.5■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.49■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.49■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A1W2PP64 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NME9Q86XW9 330 aa22.47■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.46■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
EFTUD2-215ENST00000589825 BARGINQ6ZT62 677 aa22.45■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.45■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 USP31Q70CQ4 1352 aa22.45■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.44■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.44■■□□□ 1.18
EFTUD2-215ENST00000589825 CRB1P82279 1406 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms