RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 DEFB132Q7Z7B7 95 aa37.33■■■■□ 3.57
E2F4-213ENST00000569573 ALS2Q96Q42 1657 aa37.33■■■■□ 3.57
E2F4-213ENST00000569573 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 NRAPQ86VF7 1730 aa37.28■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 PRDM11Q9NQV5 511 aa37.26■■■■□ 3.56
E2F4-213ENST00000569573 ITSN1Q15811 1721 aa37.25■■■■□ 3.55
E2F4-213ENST00000569573 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa37.24■■■■□ 3.55
E2F4-213ENST00000569573 ATP7BP35670 1465 aa37.22■■■■□ 3.55
E2F4-213ENST00000569573 BAG6P46379 1132 aa37.21■■■■□ 3.55
E2F4-213ENST00000569573 CDK19Q9BWU1 502 aa37.2■■■■□ 3.55
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa37.18■■■■□ 3.54
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa37.18■■■■□ 3.54
E2F4-213ENST00000569573 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.16■■■■□ 3.54
E2F4-213ENST00000569573 KIAA0232Q92628 1395 aa37.13■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 NUTM2GQ5VZR2 741 aa37.12■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 CCDC61Q9Y6R9 512 aa37.12■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 CHRNA2Q15822 529 aa37.11■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 STRN4Q9NRL3 753 aa37.11■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 ACEP12821 1306 aa37.1■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 FAM182BQ5T319 152 aa37.09■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa37.08■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
E2F4-213ENST00000569573 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.07■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa37.05■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa37.04■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa37.03■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 RGPD1P0DJD0 1748 aa37.03■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 EVA1CP58658 441 aa37.03■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 ABTB2Q8N961 1025 aa37.03■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 PLEKHG3A1L390 1219 aa37.02■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.02■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 USP35Q9P2H5 1018 aa37.01■■■■□ 3.52
E2F4-213ENST00000569573 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
E2F4-213ENST00000569573 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.94■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 FAM196AQ6ZSG2 479 aa36.94■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 NLRP13Q86W25 1043 aa36.93■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 SSH2Q76I76 1423 aa36.93■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.92■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 CABP2Q9NPB3 220 aa36.92■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 LRP5O75197 1615 aa36.92■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 TRIM37O94972 964 aa36.9■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 PDE3BQ13370 1112 aa36.9■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 DISP2A7MBM2 1401 aa36.89■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 BARGINQ6ZT62 677 aa36.89■■■■□ 3.5
E2F4-213ENST00000569573 USP19O94966 1318 aa36.88■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 CPDO75976 1380 aa36.88■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.86■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 GCP02774 474 aa36.85■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.85■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.83■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.83■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 APBA3O96018 575 aa36.83■■■■□ 3.49
E2F4-213ENST00000569573 CABP1Q9NZU7 370 aa36.81■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.8■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 NLRP6P59044 892 aa36.78■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.78■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.77■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 USP6P35125 1406 aa36.76■■■■□ 3.48
E2F4-213ENST00000569573 EVC2Q86UK5 1308 aa36.76■■■■□ 3.47
E2F4-213ENST00000569573 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.76■■■■□ 3.47
E2F4-213ENST00000569573 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
E2F4-213ENST00000569573 CRB1P82279 1406 aa36.7■■■■□ 3.47
E2F4-213ENST00000569573 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.66■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 NEUROD1Q13562 356 aa36.66■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 NBPF14Q5TI25 921 aa36.66■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.66■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 SLIT3O75094 1523 aa36.64■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.64■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.64■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
E2F4-213ENST00000569573 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 PIK3C2AO00443 1686 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 RREB1Q92766 1687 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 DDB1Q16531 1140 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.59■■■■□ 3.45
E2F4-213ENST00000569573 SOX12O15370 315 aa36.57■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.57■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.57■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.55■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.54■■■■□ 3.44
E2F4-213ENST00000569573 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms