RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC7Q96M83 1385 aa34.43■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.43■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 JCADQ9P266 1359 aa34.42■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.42■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.41■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.41■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.39■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 SSH2Q76I76 1423 aa34.37■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.36■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 SHPRHQ149N8 1683 aa34.36■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 ALS2Q96Q42 1657 aa34.36■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.34■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHG5O94827 1062 aa34.34■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF10O15013 1369 aa34.34■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.33■■■■□ 3.09
RBBP6-211ENST00000568316 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.31■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 ABTB2Q8N961 1025 aa34.3■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.29■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 PANK3Q9H999 370 aa34.29■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.29■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.27■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 PIK3C2AO00443 1686 aa34.26■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
RBBP6-211ENST00000568316 NME9Q86XW9 330 aa34.25■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.25■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.25■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 NLRP6P59044 892 aa34.22■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.21■■■■□ 3.07
RBBP6-211ENST00000568316 LRP6O75581 1613 aa34.19■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 NLRP13Q86W25 1043 aa34.19■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 ABCA3Q99758 1704 aa34.18■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.16■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 USP19O94966 1318 aa34.15■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 ADAMTS2O95450 1211 aa34.14■■■■□ 3.06
RBBP6-211ENST00000568316 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 USP31Q70CQ4 1352 aa34.13■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.12■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 FYB1O15117 783 aa34.12■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.12■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.11■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.11■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.1■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.1■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 SLIT3O75094 1523 aa34.09■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 USP54Q70EL1 1684 aa34.09■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 SOX12O15370 315 aa34.08■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 COG3Q96JB2 828 aa34.08■■■■□ 3.05
RBBP6-211ENST00000568316 GCP02774 474 aa34.07■■■■□ 3.04
RBBP6-211ENST00000568316 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
RBBP6-211ENST00000568316 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
RBBP6-211ENST00000568316 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
RBBP6-211ENST00000568316 C8orf37Q96NL8 207 aa34.01■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 KCNH5Q8NCM2 988 aa34■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 KIAA0232Q92628 1395 aa33.99■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 NFAT5O94916 1531 aa33.99■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.98■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 NSD2O96028 1365 aa33.98■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.97■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 NGLY1Q96IV0 654 aa33.96■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa33.96■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 CHRNA2Q15822 529 aa33.95■■■■□ 3.03
RBBP6-211ENST00000568316 FAM83GA6ND36 823 aa33.94■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 CPDO75976 1380 aa33.94■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 FBLN1P23142 703 aa33.93■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 AFF2P51816 1311 aa33.9■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 MORC1Q86VD1 984 aa33.9■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.89■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
RBBP6-211ENST00000568316 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.87■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.87■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 LTN1O94822 1766 aa33.85■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 SLIT2O94813 1529 aa33.84■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.84■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 BTG4Q9NY30 223 aa33.83■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.83■■■■□ 3.01
RBBP6-211ENST00000568316 USP21Q9UK80 565 aa33.82■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.81■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.8■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 COL18A1P39060 1754 aa33.8■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.79■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.79■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 AMPHP49418 695 aa33.78■■■■□ 3
RBBP6-211ENST00000568316 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms