RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 A0A0G2JS52 829 aa16.84■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 MYT1Q01538 1121 aa16.84■□□□□ 0.29
CS-221ENST00000550734 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CS-221ENST00000550734 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
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CS-221ENST00000550734 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CS-221ENST00000550734 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.82■□□□□ 0.28
CS-221ENST00000550734 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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CS-221ENST00000550734 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-221ENST00000550734 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.78■□□□□ 0.28
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CS-221ENST00000550734 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-221ENST00000550734 ITSN1Q15811 1721 aa16.77■□□□□ 0.28
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CS-221ENST00000550734 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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CS-221ENST00000550734 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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CS-221ENST00000550734 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-221ENST00000550734 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
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CS-221ENST00000550734 BARGINQ6ZT62 677 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-221ENST00000550734 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-221ENST00000550734 CHRNA2Q15822 529 aa16.71■□□□□ 0.27
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CS-221ENST00000550734 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 STRN4Q9NRL3 753 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 SSH2Q76I76 1423 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 APBA3O96018 575 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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CS-221ENST00000550734 CDK19Q9BWU1 502 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.68■□□□□ 0.26
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CS-221ENST00000550734 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 CPDO75976 1380 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 ACEP12821 1306 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 EVA1CP58658 441 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 PDE3BQ13370 1112 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-221ENST00000550734 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.66■□□□□ 0.26
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CS-221ENST00000550734 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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CS-221ENST00000550734 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 PEAK1Q9H792 1746 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 GCP02774 474 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 NLRP13Q86W25 1043 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-221ENST00000550734 SBF2Q86WG5 1849 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 CRB1P82279 1406 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 SPON1Q9HCB6 807 aa16.57■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 PLSCR1O15162 318 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 KCNQ2O43526 872 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 YY1P25490 414 aa16.56■□□□□ 0.24
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CS-221ENST00000550734 SLIT3O75094 1523 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-221ENST00000550734 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 LRRC37A3O60309 1634 aa16.54■□□□□ 0.24
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CS-221ENST00000550734 UTRNP46939 3433 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 NEUROD1Q13562 356 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 CABP2Q9NPB3 220 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CS-221ENST00000550734 BCL9O00512 1426 aa16.52■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 USP6P35125 1406 aa16.52■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 CASZ1Q86V15 1759 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CS-221ENST00000550734 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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