RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 PLEKHG5O94827 1062 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 NRAPQ86VF7 1730 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 ARHGEF10O15013 1369 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 LTN1O94822 1766 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 RGPD5Q99666 1765 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 SSH2Q76I76 1423 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PP64 1363 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 ADAMTS2O95450 1211 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 TMF1P82094 1093 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 TMC1Q8TDI8 760 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-211ENST00000548041 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 SLIT3O75094 1523 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 C8orf37Q96NL8 207 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 AFF2P51816 1311 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 COL18A1P39060 1754 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 ILDR2Q71H61 639 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 ABTB2Q8N961 1025 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 SLIT2O94813 1529 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 SLC24A1O60721 1099 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 POTEAQ6S8J7 498 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 NFAT5O94916 1531 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 USP19O94966 1318 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-211ENST00000548041 GLI3P10071 1580 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 NGLY1Q96IV0 654 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 CDCA8Q53HL2 280 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 NME9Q86XW9 330 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 KIAA0232Q92628 1395 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 RGPD2P0DJD1 1756 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 NLRP6P59044 892 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 NLRP13Q86W25 1043 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 ATRNO75882 1429 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 NSD3Q9BZ95 1437 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 USP21Q9UK80 565 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 USP31Q70CQ4 1352 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 FAM83GA6ND36 823 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 SOX12O15370 315 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 GCP02774 474 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 CHRNA2Q15822 529 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 PEAK1Q9H792 1746 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 CPDO75976 1380 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 RGS12O14924 1447 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-211ENST00000548041 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.96□□□□□ -0.49
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CS-211ENST00000548041 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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CS-211ENST00000548041 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 ABCC6O95255 1503 aa11.96□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 CCDC7Q96M83 1385 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 EP400Q96L91 3159 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 FYB1O15117 783 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 RXRBP28702 533 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.93□□□□□ -0.5
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