RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 BCAR3O75815 825 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 TECPR2O15040 1411 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-205ENST00000546891 FYB1O15117 783 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 NEFMP07197 916 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 NEUROD2Q15784 382 aa12.56□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.56□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 CPS1P31327 1500 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 ZNF428Q96B54 188 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 TNRQ92752 1358 aa12.55□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 FCHSD2O94868 740 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 CABP1Q9NZU7 370 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-205ENST00000546891 USP35Q9P2H5 1018 aa12.53□□□□□ -0.4
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CS-205ENST00000546891 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 COG6Q9Y2V7 657 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 KIF16BQ96L93 1317 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.52□□□□□ -0.41
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CS-205ENST00000546891 C8orf34Q49A92 452 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
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CS-205ENST00000546891 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.5□□□□□ -0.41
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CS-205ENST00000546891 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 RGS3P49796 1198 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 RIPK4P57078 832 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 MLECQ14165 292 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 METP08581 1390 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.47□□□□□ -0.41
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CS-205ENST00000546891 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 COG3Q96JB2 828 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 POLKQ9UBT6 870 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 NFE2L2Q16236 605 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-205ENST00000546891 ITSN1Q15811 1721 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 AKAP12Q02952 1782 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 RLBP1P12271 317 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 PRKAR2BP31323 418 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 GNAI1P63096 354 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 NBR1Q14596 966 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 IFT57Q9NWB7 429 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 C3P01024 1663 aa12.44□□□□□ -0.42
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CS-205ENST00000546891 BECN1Q14457 450 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 SKAP1Q86WV1 359 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 DIP2AQ14689 1571 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 TRIM27P14373 513 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 IL13P35225 146 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 PTCH1Q13635 1447 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-205ENST00000546891 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.41□□□□□ -0.42
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