RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		12.97	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	USP6	P35125	1406 aa		12.96	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.96	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.96	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.96	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	SOX12	O15370	315 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.92	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	NME9	Q86XW9	330 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.9	□□□□□ -0.34
MLH1-222	ENST00000539477	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	LTN1	O94822	1766 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	FBLN1	P23142	703 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP6	P59044	892 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	CHRNA2	Q15822	529 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	PANK3	Q9H999	370 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	SLC24A1	O60721	1099 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.35
MLH1-222	ENST00000539477	AFF2	P51816	1311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	SLIT3	O75094	1523 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	NFAT5	O94916	1531 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	USP19	O94966	1318 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	FYB1	O15117	783 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	GC	P02774	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	FAM83G	A6ND36	823 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.81	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	POTEA	Q6S8J7	498 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	COL18A1	P39060	1754 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		12.79	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	BTG4	Q9NY30	223 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	COG3	Q96JB2	828 aa		12.77	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.77	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	USP21	Q9UK80	565 aa		12.77	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.77	□□□□□ -0.36
MLH1-222	ENST00000539477	SLIT2	O94813	1529 aa		12.77	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.75	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
MLH1-222	ENST00000539477	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37

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