RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 AFF2P51816 1311 aa30.83■■■□□ 2.53
PTPRK-222ENST00000532751 NGLY1Q96IV0 654 aa30.83■■■□□ 2.53
PTPRK-222ENST00000532751 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PTPRK-222ENST00000532751 AKAP12Q02952 1782 aa30.82■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHG5O94827 1062 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 TMF1P82094 1093 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 USP6P35125 1406 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 POTEAQ6S8J7 498 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 TMC1Q8TDI8 760 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRK-222ENST00000532751 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.76■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 ABTB2Q8N961 1025 aa30.75■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 CDCA8Q53HL2 280 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 USP21Q9UK80 565 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP13Q86W25 1043 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 SSH2Q76I76 1423 aa30.69■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.67■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.66■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 PIK3C2AO00443 1686 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 SLIT2O94813 1529 aa30.64■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PTPRK-222ENST00000532751 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 RXRBP28702 533 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP6P59044 892 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 USP19O94966 1318 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PP64 1363 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 FAM83GA6ND36 823 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM11Q9NQV5 511 aa30.59■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 ATRNO75882 1429 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRK-222ENST00000532751 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0232Q92628 1395 aa30.56■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 SLIT3O75094 1523 aa30.56■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 GCP02774 474 aa30.55■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 SOCS7O14512 581 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 BTG4Q9NY30 223 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 NRAPQ86VF7 1730 aa30.53■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 MYOM1P52179 1685 aa30.52■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 CPDO75976 1380 aa30.52■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 USP54Q70EL1 1684 aa30.52■■■□□ 2.48
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 USP31Q70CQ4 1352 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 CHRNA2Q15822 529 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 NME9Q86XW9 330 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 VPS72Q15906 364 aa30.47■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PTPRK-222ENST00000532751 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 RGS12O14924 1447 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 GLI3P10071 1580 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 LMO7Q8WWI1 1683 aa30.42■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 SOX12O15370 315 aa30.42■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 NFAT5O94916 1531 aa30.4■■■□□ 2.46
PTPRK-222ENST00000532751 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.39■■■□□ 2.46
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PTPRK-222ENST00000532751 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.39■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.39■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.39■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 COG3Q96JB2 828 aa30.38■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 STRN4Q9NRL3 753 aa30.38■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa30.38■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.37■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 COL18A1P39060 1754 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 LTN1O94822 1766 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.33■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
PTPRK-222ENST00000532751 FYB1O15117 783 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 RGPD5Q99666 1765 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 ABCC6O95255 1503 aa30.32■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PTPRK-222ENST00000532751 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.31■■■□□ 2.44
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