RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.92■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 SBNO1A3KN83 1393 aa23.91■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 ABCC11Q96J66 1382 aa23.91■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 STK26Q9P289 416 aa23.9■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PACS1-208ENST00000529677 A0A0G2JS52 829 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 MYT1Q01538 1121 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 ALS2Q96Q42 1657 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 ADGRB2O60241 1585 aa23.88■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.87■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.86■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 BTG4Q9NY30 223 aa23.86■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.85■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.85■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 DLC1Q96QB1 1528 aa23.85■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF10O15013 1369 aa23.85■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PACS1-208ENST00000529677 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.81■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 PSME1Q06323 249 aa23.8■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 TRIM37O94972 964 aa23.79■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.79■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 UTRNP46939 3433 aa23.78■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.78■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 SIRT1Q96EB6 747 aa23.77■■□□□ 1.4
PACS1-208ENST00000529677 USP47Q96K76 1375 aa23.76■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.74■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.73■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 APBA3O96018 575 aa23.72■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.72■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 CASZ1Q86V15 1759 aa23.71■■□□□ 1.39
PACS1-208ENST00000529677 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.7■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.7■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.7■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.7■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.69■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.67■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.66■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 KCNQ2O43526 872 aa23.66■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 SPON1Q9HCB6 807 aa23.66■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 MYOM1P52179 1685 aa23.64■■□□□ 1.38
PACS1-208ENST00000529677 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.63■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 PRAM1Q96QH2 718 aa23.63■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 KIAA0232Q92628 1395 aa23.63■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 TESK2Q96S53 571 aa23.62■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.61■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 PEAK1Q9H792 1746 aa23.61■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.6■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 CHRNA2Q15822 529 aa23.6■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 IFFO2Q5TF58 517 aa23.59■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 NBPF14Q5TI25 921 aa23.59■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 POGKQ9P215 609 aa23.59■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.58■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PACS1-208ENST00000529677 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.58■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 SSH2Q76I76 1423 aa23.57■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 SLC24A1O60721 1099 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 BARGINQ6ZT62 677 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 STRN4Q9NRL3 753 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 SBF2Q86WG5 1849 aa23.56■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 USP35Q9P2H5 1018 aa23.54■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 PTGER2P43116 358 aa23.52■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 CHD4Q14839 1912 aa23.52■■□□□ 1.36
PACS1-208ENST00000529677 C1QTNF8P60827 252 aa23.51■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.5■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 PDE3BQ13370 1112 aa23.5■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 CEP350Q5VT06 3117 aa23.49■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.49■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 ATP7BP35670 1465 aa23.48■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 LRRC37A3O60309 1634 aa23.48■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 TMF1P82094 1093 aa23.47■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 EVC2Q86UK5 1308 aa23.47■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PACS1-208ENST00000529677 ITSN1Q15811 1721 aa23.45■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB7AO95365 584 aa23.45■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 PROM2Q8N271 834 aa23.45■■□□□ 1.34
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