RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529362.1

GATD1-210, Transcript of glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene GATD1, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1-210ENST00000529362 PIK3C2AO00443 1686 aa33.2■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.19■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF10O15013 1369 aa33.17■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.15■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 A0A1W2PP64 1363 aa33.14■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.14■■■□□ 2.9
GATD1-210ENST00000529362 TMC1Q8TDI8 760 aa33.13■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 PLEKHG5O94827 1062 aa33.12■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 SLC24A1O60721 1099 aa33.11■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.09■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 ADAMTS2O95450 1211 aa33.08■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 NINLQ9Y2I6 1382 aa33.08■■■□□ 2.89
GATD1-210ENST00000529362 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.05■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 USP54Q70EL1 1684 aa33.04■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.03■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.02■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 USP19O94966 1318 aa33.02■■■□□ 2.88
GATD1-210ENST00000529362 ABTB2Q8N961 1025 aa33.01■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 C8orf37Q96NL8 207 aa33.01■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 SLIT3O75094 1523 aa33.01■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 CDCA8Q53HL2 280 aa33■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.98■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.97■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 AFF2P51816 1311 aa32.97■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.96■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.95■■■□□ 2.87
GATD1-210ENST00000529362 NME9Q86XW9 330 aa32.94■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.94■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 KIF7Q2M1P5 1343 aa32.94■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 SLIT2O94813 1529 aa32.93■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 POTEAQ6S8J7 498 aa32.93■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NRAPQ86VF7 1730 aa32.93■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.92■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.92■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NLRP6P59044 892 aa32.91■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.91■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NFAT5O94916 1531 aa32.91■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NWD2Q9ULI1 1742 aa32.91■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NGLY1Q96IV0 654 aa32.9■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.89■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.89■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 USP31Q70CQ4 1352 aa32.89■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 NLRP13Q86W25 1043 aa32.89■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
GATD1-210ENST00000529362 KIAA0232Q92628 1395 aa32.88■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.88■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 FAM83GA6ND36 823 aa32.87■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 ILDR2Q71H61 639 aa32.87■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.85■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 COL18A1P39060 1754 aa32.84■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 GCP02774 474 aa32.84■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.83■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 CCDC7Q96M83 1385 aa32.83■■■□□ 2.85
GATD1-210ENST00000529362 CPDO75976 1380 aa32.82■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 ATRNO75882 1429 aa32.81■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 CHRNA2Q15822 529 aa32.81■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 USP21Q9UK80 565 aa32.81■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 LTN1O94822 1766 aa32.8■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.78■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.78■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 FYB1O15117 783 aa32.77■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 RGPD5Q99666 1765 aa32.77■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 GLI3P10071 1580 aa32.76■■■□□ 2.84
GATD1-210ENST00000529362 SOX12O15370 315 aa32.76■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 PANK3Q9H999 370 aa32.76■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.75■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.74■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.73■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 BTG4Q9NY30 223 aa32.73■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.7■■■□□ 2.83
GATD1-210ENST00000529362 FBLN1P23142 703 aa32.68■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.68■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.67■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.66■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 COG3Q96JB2 828 aa32.66■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.65■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 ABCC6O95255 1503 aa32.65■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 RGS12O14924 1447 aa32.64■■■□□ 2.82
GATD1-210ENST00000529362 PEAK1Q9H792 1746 aa32.63■■■□□ 2.81
GATD1-210ENST00000529362 VPS72Q15906 364 aa32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms