RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	PSME1	Q06323	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDAC2-215	ENST00000523334	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDAC2-215	ENST00000523334	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDAC2-215	ENST00000523334	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HDAC2-215	ENST00000523334	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
HDAC2-215	ENST00000523334	LTK	P29376	864 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	GNAI1	P63096	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ACE	P12821	1306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	MET	P08581	1390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	FBLN1	P23142	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	AAMP	Q13685	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	KCNA6	P17658	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ATF3	P18847	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PDE4A	P27815	886 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PPL	O60437	1756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	IL16	Q14005	1332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ATP7B	P35670	1465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PTPRM	P28827	1452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	FOXO3	O43524	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TEF	Q10587	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	BECN1	Q14457	450 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HDAC2-215	ENST00000523334	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms