RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.23■□□□□ 0.19
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0G2JS52 829 aa16.22■□□□□ 0.19
UBE2B-208ENST00000511807 MYT1Q01538 1121 aa16.22■□□□□ 0.19
UBE2B-208ENST00000511807 BTG4Q9NY30 223 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 TONSLQ96HA7 1378 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 ABCA3Q99758 1704 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.18■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.17■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 CDK19Q9BWU1 502 aa16.17■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 ATP7BP35670 1465 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 ALS2Q96Q42 1657 aa16.14■□□□□ 0.18
UBE2B-208ENST00000511807 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.13■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 CHRNA2Q15822 529 aa16.12■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.12■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 ACEP12821 1306 aa16.12■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA0232Q92628 1395 aa16.12■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.11■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.11■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.11■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 NRAPQ86VF7 1730 aa16.11■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 FAM182BQ5T319 152 aa16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 STRN4Q9NRL3 753 aa16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 EP400Q96L91 3159 aa16.1■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 BAG6P46379 1132 aa16.09■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 ITSN1Q15811 1721 aa16.08■□□□□ 0.17
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.08■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 ABTB2Q8N961 1025 aa16.08■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.06■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.06■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 EVA1CP58658 441 aa16.06■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 CABP2Q9NPB3 220 aa16.06■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.05■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 USP35Q9P2H5 1018 aa16.05■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.04■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.04■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.04■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP13Q86W25 1043 aa16.02■□□□□ 0.16
UBE2B-208ENST00000511807 USP19O94966 1318 aa16.01■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.01■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 CABP1Q9NZU7 370 aa16.01■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.01■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 SSH2Q76I76 1423 aa16.01■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 GCP02774 474 aa16■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 CPDO75976 1380 aa16■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM37O94972 964 aa15.99■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 PDE3BQ13370 1112 aa15.99■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.99■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP6P59044 892 aa15.98■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 BARGINQ6ZT62 677 aa15.98■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.98■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 EVC2Q86UK5 1308 aa15.97■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.97■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.97■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.96■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 USP6P35125 1406 aa15.96■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBE2B-208ENST00000511807 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.95■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 APBA3O96018 575 aa15.95■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 DISP2A7MBM2 1401 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 SOX12O15370 315 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 CRB1P82279 1406 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.9■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 LRP5O75197 1615 aa15.9■□□□□ 0.14
UBE2B-208ENST00000511807 SLIT3O75094 1523 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms