RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCA3Q99758 1704 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.8■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ITSN1Q15811 1721 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ALS2Q96Q42 1657 aa27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP7BP35670 1465 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ACEP12821 1306 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ABTB2Q8N961 1025 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.71■■■□□ 2.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EVA1CP58658 441 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0232Q92628 1395 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNA2Q15822 529 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 STRN4Q9NRL3 753 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NRAPQ86VF7 1730 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 BAG6P46379 1132 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CABP2Q9NPB3 220 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP13Q86W25 1043 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NEUROD1Q13562 356 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CABP1Q9NZU7 370 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 USP35Q9P2H5 1018 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM182BQ5T319 152 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 EVC2Q86UK5 1308 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2-220ENST00000511663 EP400Q96L91 3159 aa27.58■■■□□ 2.01
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SH3BP2-220ENST00000511663 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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SH3BP2-220ENST00000511663 PDE3BQ13370 1112 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 USP19O94966 1318 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 CPDO75976 1380 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 BARGINQ6ZT62 677 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP2-220ENST00000511663 SSH2Q76I76 1423 aa27.51■■□□□ 1.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 USP6P35125 1406 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM37O94972 964 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP2-220ENST00000511663 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 APBA3O96018 575 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-220ENST00000511663 DISP2A7MBM2 1401 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 CRB1P82279 1406 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLIT3O75094 1523 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 TONSLQ96HA7 1378 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-220ENST00000511663 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.32■■□□□ 1.96
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SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF14Q5TI25 921 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 TMC1Q8TDI8 760 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3C2AO00443 1686 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-220ENST00000511663 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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