RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510780.5

RASGEF1B-208, Transcript of RasGEF domain family member 1B, human

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ATP7B	P35670	1465 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RASGEF1B-208	ENST00000510780	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RASGEF1B-208	ENST00000510780		A0A0G2JS52	829 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MYT1	Q01538	1121 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ACE	P12821	1306 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RASGEF1B-208	ENST00000510780	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	BAG6	P46379	1132 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	USP35	Q9P2H5	1018 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	EVA1C	P58658	441 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	USP19	O94966	1318 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CPD	O75976	1380 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TRIM37	O94972	964 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	GC	P02774	474 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LRP5	O75197	1615 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	USP6	P35125	1406 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NLRP6	P59044	892 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SLIT3	O75094	1523 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	APBA3	O96018	575 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	COL18A1	P39060	1754 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CRB1	P82279	1406 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RREB1	Q92766	1687 aa		31.51	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.51	■■■□□ 2.64
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SOX12	O15370	315 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.45	■■■□□ 2.63
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.41	■■■□□ 2.62

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