RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.46■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF521Q96K83 1311 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 ACEP12821 1306 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4-212ENST00000494815 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 APAF1O14727 1248 aa24.39■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 NME9Q86XW9 330 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 USP6P35125 1406 aa24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 RUNDC1Q96C34 613 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 NUTM2FA1L443 756 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 COG3Q96JB2 828 aa24.36■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 GOLGA2Q08379 1002 aa24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 POLKQ9UBT6 870 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 SSH2Q76I76 1423 aa24.33■■□□□ 1.49
TSPAN4-212ENST00000494815 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 NWD1Q149M9 1564 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.31■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.3■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 SLFN5Q08AF3 891 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC27Q2M243 656 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 WWC1Q8IX03 1113 aa24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 E9PSI1 815 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 FBLN1P23142 703 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 USP31Q70CQ4 1352 aa24.23■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4-212ENST00000494815 FCHSD2O94868 740 aa24.2■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 WDR63Q8IWG1 891 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 IL13P35225 146 aa24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 NEUROD2Q15784 382 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 C14orf37Q86TY3 774 aa24.16■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 PIK3C2AO00443 1686 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.14■■□□□ 1.46
TSPAN4-212ENST00000494815 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.14■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 USP54Q70EL1 1684 aa24.13■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 NEFMP07197 916 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 PRKAR2BP31323 418 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 HSPA2P54652 639 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 NLRP6P59044 892 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 PEAK1Q9H792 1746 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 SBNO1A3KN83 1393 aa24.06■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.06■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.06■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.06■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 FLT4P35916 1363 aa24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 ABTB2Q8N961 1025 aa24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 DCCP43146 1447 aa24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4-212ENST00000494815 IL16Q14005 1332 aa24.05■■□□□ 1.44
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