RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 SLFN5Q08AF3 891 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 RUNDC1Q96C34 613 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.3■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 E9PSI1 815 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 CCDC27Q2M243 656 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-211ENST00000492185 WWC1Q8IX03 1113 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 NME9Q86XW9 330 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 POLKQ9UBT6 870 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 SSH2Q76I76 1423 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 USP6P35125 1406 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 ACEP12821 1306 aa26.2■■□□□ 1.79
NELFE-211ENST00000492185 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 WDR63Q8IWG1 891 aa26.2■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 KCNA6P17658 529 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 COG3Q96JB2 828 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NELFE-211ENST00000492185 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 USP31Q70CQ4 1352 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 FBLN1P23142 703 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 FCHSD2O94868 740 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 USP54Q70EL1 1684 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 NWD1Q149M9 1564 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 IL13P35225 146 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 NUTM2FA1L443 756 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 PLIN1O60240 522 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 NEUROD2Q15784 382 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-211ENST00000492185 PIK3C2AO00443 1686 aa26.06■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 PEAK1Q9H792 1746 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 IL16Q14005 1332 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 CRBNQ96SW2 442 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-211ENST00000492185 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 PRKAR2BP31323 418 aa25.99■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 BCAR3O75815 825 aa25.96■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 RIPK4P57078 832 aa25.95■■□□□ 1.75
NELFE-211ENST00000492185 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.95■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 NFE2L2Q16236 605 aa25.94■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.93■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 PDE3AQ14432 1141 aa25.92■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.92■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 HMOX1P09601 288 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 SBNO1A3KN83 1393 aa25.9■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 NEFMP07197 916 aa25.9■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.9■■□□□ 1.74
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.89■■□□□ 1.73
NELFE-211ENST00000492185 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.88■■□□□ 1.73
NELFE-211ENST00000492185 FLT4P35916 1363 aa25.87■■□□□ 1.73
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF10O15013 1369 aa25.85■■□□□ 1.73
NELFE-211ENST00000492185 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.84■■□□□ 1.73
NELFE-211ENST00000492185 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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