RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa44.89■■■■■ 4.78
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LDB1-204ENST00000490751 TONSLQ96HA7 1378 aa44.89■■■■■ 4.78
LDB1-204ENST00000490751 PLEKHG3A1L390 1219 aa44.88■■■■■ 4.78
LDB1-204ENST00000490751 NWD2Q9ULI1 1742 aa44.88■■■■■ 4.78
LDB1-204ENST00000490751 CABP2Q9NPB3 220 aa44.87■■■■■ 4.77
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LDB1-204ENST00000490751 ATAD2Q6PL18 1390 aa44.69■■■■■ 4.75
LDB1-204ENST00000490751 CABP1Q9NZU7 370 aa44.69■■■■■ 4.74
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LDB1-204ENST00000490751 PRDM11Q9NQV5 511 aa44.64■■■■■ 4.74
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LDB1-204ENST00000490751 AKAP12Q02952 1782 aa44.53■■■■■ 4.72
LDB1-204ENST00000490751 NLRP13Q86W25 1043 aa44.52■■■■■ 4.72
LDB1-204ENST00000490751 SEPT12Q8IYM1 358 aa44.52■■■■■ 4.72
LDB1-204ENST00000490751 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
LDB1-204ENST00000490751 SSH2Q76I76 1423 aa44.49■■■■■ 4.71
LDB1-204ENST00000490751 PIK3C2AO00443 1686 aa44.46■■■■■ 4.71
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LDB1-204ENST00000490751 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa44.43■■■■■ 4.7
LDB1-204ENST00000490751 GCP02774 474 aa44.42■■■■■ 4.7
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LDB1-204ENST00000490751 NLRP6P59044 892 aa44.41■■■■■ 4.7
LDB1-204ENST00000490751 MYT1Q01538 1121 aa44.41■■■■■ 4.7
LDB1-204ENST00000490751 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
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LDB1-204ENST00000490751 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa44.32■■■■■ 4.69
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LDB1-204ENST00000490751 TTC21AQ8NDW8 1320 aa44.31■■■■■ 4.68
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LDB1-204ENST00000490751 CD163L1Q9NR16 1453 aa44.28■■■■■ 4.68
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LDB1-204ENST00000490751 ARHGEF25Q86VW2 580 aa44.1■■■■■ 4.65
LDB1-204ENST00000490751 NINLQ9Y2I6 1382 aa44.09■■■■■ 4.65
LDB1-204ENST00000490751 NME9Q86XW9 330 aa44.09■■■■■ 4.65
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