RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, human

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ATP7B	P35670	1465 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.16	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
RPS6KB1-208	ENST00000489824	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.13	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		28.11	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ACE	P12821	1306 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NRAP	Q86VF7	1730 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	STRN4	Q9NRL3	753 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	BAG6	P46379	1132 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		28	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EVA1C	P58658	441 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CABP2	Q9NPB3	220 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NLRP13	Q86W25	1043 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NEUROD1	Q13562	356 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	USP35	Q9P2H5	1018 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	USP19	O94966	1318 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CABP1	Q9NZU7	370 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EVC2	Q86UK5	1308 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CPD	O75976	1380 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SSH2	Q76I76	1423 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GC	P02774	474 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	USP6	P35125	1406 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NLRP6	P59044	892 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TRIM37	O94972	964 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.04
RPS6KB1-208	ENST00000489824	APBA3	O96018	575 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CRB1	P82279	1406 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SLIT3	O75094	1523 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SOX12	O15370	315 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LRP5	O75197	1615 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PIK3C2A	O00443	1686 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RPS6KB1-208	ENST00000489824	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DDB1	Q16531	1140 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms