RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-211	ENST00000489495	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	C3orf80	F5H4A9	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ERBB3	P21860	1342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PHF14	O94880	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PTMS	P20962	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	NUDT7	P0C024	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	USP19	O94966	1318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	BRD1	O95696	1058 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	UQCRH	P07919	91 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	KCNA1	Q09470	495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC34A2	O95436	690 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-211	ENST00000489495	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PLIN1	O60240	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	RALBP1	Q15311	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	FOSB	P53539	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	EPAS1	Q99814	870 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	INSR	P06213	1382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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