RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-211ENST00000486161 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRD-211ENST00000486161 FYB1O15117 783 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-211ENST00000486161 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-211ENST00000486161 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-211ENST00000486161 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 HMMRO75330 724 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 RGS3P49796 1198 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 AGLP35573 1532 aa10.46□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.45□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC184Q52MB2 194 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 WDR63Q8IWG1 891 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 KIF16BQ96L93 1317 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 KIF1BO60333 1816 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 NFE2L2Q16236 605 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3C2GO75747 1445 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PP64 1363 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3R4Q99570 1358 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS2O95450 1211 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 ABCA6Q8N139 1617 aa10.41□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 CABP4P57796 275 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 NECTIN2Q92692 538 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP44Q96MT7 982 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRD-211ENST00000486161 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.39□□□□□ -0.75
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PTPRD-211ENST00000486161 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
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PTPRD-211ENST00000486161 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 CLTCL1P53675 1640 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 ORAI2Q96SN7 254 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
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PTPRD-211ENST00000486161 CHRNA2Q15822 529 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF428Q96B54 188 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 CEP152O94986 1710 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRB3O60242 1522 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 AAMPQ13685 434 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRD-211ENST00000486161 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.36□□□□□ -0.75
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