RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 INSRP06213 1382 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 CABP1Q9NZU7 370 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 FSD2A1L4K1 749 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 RLBP1P12271 317 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRB3O60242 1522 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC3O15438 1527 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2FA1L443 756 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 TPM2P07951 284 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 CDK19Q9BWU1 502 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 GBP4Q96PP9 640 aa20.28■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PP64 1363 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.27■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 FYB1O15117 783 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 HMOX1P09601 288 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 SOX12O15370 315 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRB1O14514 1584 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 RIPK4P57078 832 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 PDE3AQ14432 1141 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-204ENST00000483092 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 GLI2P10070 1586 aa20.2■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.19■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 IFT172Q9UG01 1749 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 PPLO60437 1756 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 WDR63Q8IWG1 891 aa20.18■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 MPNDQ8N594 471 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 LNPKQ9C0E8 428 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 PRKAR2BP31323 418 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 NGEFQ8N5V2 710 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-204ENST00000483092 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 UQCRHP07919 91 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 NEO1Q92859 1461 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 NME9Q86XW9 330 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 TSPOAP1O95153 1857 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 SSFA2P28290 1259 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 MCTP1Q6DN14 999 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM27P14373 513 aa20.1■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 RNF214Q8ND24 703 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.1 ms