RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.44■■■■□ 3.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.4■■■■□ 3.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.4■■■■□ 3.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 NRAPQ86VF7 1730 aa34.39■■■■□ 3.1
PRKRIP1-205ENST00000477886 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 EP400Q96L91 3159 aa34.37■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.37■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.36■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.35■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.35■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 ACEP12821 1306 aa34.32■■■■□ 3.09
PRKRIP1-205ENST00000477886 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.32■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.31■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.28■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.28■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHRNA2Q15822 529 aa34.27■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIAA0232Q92628 1395 aa34.26■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
PRKRIP1-205ENST00000477886 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 STRN4Q9NRL3 753 aa34.25■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.24■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABTB2Q8N961 1025 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 CABP2Q9NPB3 220 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.23■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 NEUROD1Q13562 356 aa34.22■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM182BQ5T319 152 aa34.18■■■■□ 3.06
PRKRIP1-205ENST00000477886 EVA1CP58658 441 aa34.17■■■■□ 3.06
PRKRIP1-205ENST00000477886 USP35Q9P2H5 1018 aa34.15■■■■□ 3.06
PRKRIP1-205ENST00000477886 BAG6P46379 1132 aa34.14■■■■□ 3.06
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 NLRP13Q86W25 1043 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.11■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.1■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 CABP1Q9NZU7 370 aa34.1■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.07■■■■□ 3.05
PRKRIP1-205ENST00000477886 EVC2Q86UK5 1308 aa34.06■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 USP19O94966 1318 aa34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 SSH2Q76I76 1423 aa34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 GCP02774 474 aa34.04■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.03■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 NLRP6P59044 892 aa34.02■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 CPDO75976 1380 aa34.01■■■■□ 3.04
PRKRIP1-205ENST00000477886 USP6P35125 1406 aa34.01■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.99■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDE3BQ13370 1112 aa33.98■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM196AQ6ZSG2 479 aa33.97■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.96■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM37O94972 964 aa33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 BARGINQ6ZT62 677 aa33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIK3C2AO00443 1686 aa33.9■■■■□ 3.02
PRKRIP1-205ENST00000477886 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
PRKRIP1-205ENST00000477886 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.9■■■■□ 3.02
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOX12O15370 315 aa33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLIT3O75094 1523 aa33.88■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 APBA3O96018 575 aa33.87■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 AKAP12Q02952 1782 aa33.86■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 CRB1P82279 1406 aa33.85■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 DISP2A7MBM2 1401 aa33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.84■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.83■■■■□ 3.01
PRKRIP1-205ENST00000477886 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 TONSLQ96HA7 1378 aa33.82■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.79■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 LRP5O75197 1615 aa33.79■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.79■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.78■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
PRKRIP1-205ENST00000477886 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMC1Q8TDI8 760 aa33.76■■■□□ 2.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 COL18A1P39060 1754 aa33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.75■■■□□ 2.99
PRKRIP1-205ENST00000477886 RGPD5Q99666 1765 aa33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms