RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.43■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 WDR63Q8IWG1 891 aa33.43■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 AAMPQ13685 434 aa33.41■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 CCDC27Q2M243 656 aa33.41■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.4■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 DLC1Q96QB1 1528 aa33.4■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 PRAM1Q96QH2 718 aa33.4■■■□□ 2.94
OPN3-204ENST00000469376 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
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OPN3-204ENST00000469376 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
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OPN3-204ENST00000469376 MTHFSP49914 203 aa33.36■■■□□ 2.93
OPN3-204ENST00000469376 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.36■■■□□ 2.93
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OPN3-204ENST00000469376 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
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OPN3-204ENST00000469376 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.3■■■□□ 2.92
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OPN3-204ENST00000469376 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.27■■■□□ 2.92
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OPN3-204ENST00000469376 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa33.19■■■□□ 2.9
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OPN3-204ENST00000469376 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.9
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OPN3-204ENST00000469376 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
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OPN3-204ENST00000469376 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
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OPN3-204ENST00000469376 USP19O94966 1318 aa33.06■■■□□ 2.88
OPN3-204ENST00000469376 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.05■■■□□ 2.88
OPN3-204ENST00000469376 IL16Q14005 1332 aa33.05■■■□□ 2.88
OPN3-204ENST00000469376 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa33.05■■■□□ 2.88
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OPN3-204ENST00000469376 BCL2L13Q9BXK5 485 aa33.03■■■□□ 2.88
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OPN3-204ENST00000469376 TMPOP42166 694 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
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OPN3-204ENST00000469376 GSE1Q14687 1217 aa32.93■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.93■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 SEC24BO95487 1268 aa32.92■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
OPN3-204ENST00000469376 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
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