RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469356.3

SREBF1-208, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 3

Gene SREBF1, Length 1,323 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-208	ENST00000469356	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SREBF1-208	ENST00000469356	PANK3	Q9H999	370 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.52	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.51	■■■□□ 2.64
SREBF1-208	ENST00000469356	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	NLRP6	P59044	892 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
SREBF1-208	ENST00000469356	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	NME9	Q86XW9	330 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	COG3	Q96JB2	828 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	FYB1	O15117	783 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SREBF1-208	ENST00000469356	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	NSD2	O96028	1365 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	USP19	O94966	1318 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SREBF1-208	ENST00000469356	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.32	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	GC	P02774	474 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	SLIT3	O75094	1523 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SREBF1-208	ENST00000469356	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	SOX12	O15370	315 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SREBF1-208	ENST00000469356	CPD	O75976	1380 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	LRP6	O75581	1613 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	NFAT5	O94916	1531 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SREBF1-208	ENST00000469356	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	AMPH	P49418	695 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	RALBP1	Q15311	655 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	LTN1	O94822	1766 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SREBF1-208	ENST00000469356	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	ABCC6	O95255	1503 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	IP6K1	Q92551	441 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	AFF2	P51816	1311 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	FBLN1	P23142	703 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	EVA1C	P58658	441 aa		31.03	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
SREBF1-208	ENST00000469356	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.02	■■■□□ 2.56

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