RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439822.6

PLEKHB2-208, Transcript of pleckstrin homology domain containing B2, human

TSL 3 BASIC

Gene PLEKHB2, Length 4,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		15.03	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ACE	P12821	1306 aa		15.03	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MCM10	Q7L590	875 aa		15.03	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	IGHD	P01880	384 aa		15.02	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FAM161A	Q3B820	660 aa		15.02	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RLBP1	P12271	317 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	BACH2	Q9BYV9	841 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MYOM2	P54296	1465 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FCHSD2	O94868	740 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF428	Q96B54	188 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LNPK	Q9C0E8	428 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MET	P08581	1390 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PDE3A	Q14432	1141 aa		15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ABCA6	Q8N139	1617 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GNAI1	P63096	354 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NFE2L2	Q16236	605 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		14.97	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		14.96	□□□□□ -0.01
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TRIM27	P14373	513 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FOXO3	O43524	673 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KCNA6	P17658	529 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KRT24	Q2M2I5	525 aa		14.95	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	BECN1	Q14457	450 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	STK31	Q9BXU1	1019 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SYNM	O15061	1565 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TSPYL6	Q8N831	410 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NSD2	O96028	1365 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KIF16B	Q96L93	1317 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF521	Q96K83	1311 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ADGRB3	O60242	1522 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ABCC11	Q96J66	1382 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MBIP	Q9NS73	344 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLC4A2	P04920	1241 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MROH2A	A6NES4	1674 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GLI2	P10070	1586 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TEF	Q10587	303 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DEPDC5	O75140	1603 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822		F6X3S4	739 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		14.85	□□□□□ -0.03
PLEKHB2-208	ENST00000439822	IL13	P35225	146 aa		14.85	□□□□□ -0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104 ms