RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439189.1

RPL13AP5-201, Transcript of ribosomal protein L13a pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene RPL13AP5, Length 612 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP5-201ENST00000439189 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.99■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 FAM83GA6ND36 823 aa17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 VPS72Q15906 364 aa17.98■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.97■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 ALS2Q96Q42 1657 aa17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 ABTB2Q8N961 1025 aa17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 PRDM11Q9NQV5 511 aa17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 CABP1Q9NZU7 370 aa17.96■□□□□ 0.47
RPL13AP5-201ENST00000439189 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 QRICH2Q9H0J4 1663 aa17.95■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 NLRP13Q86W25 1043 aa17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 BTG4Q9NY30 223 aa17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 SLC24A1O60721 1099 aa17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.93■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 ABCA3Q99758 1704 aa17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.91■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 USP6P35125 1406 aa17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 USP19O94966 1318 aa17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 KIAA0232Q92628 1395 aa17.9■□□□□ 0.46
RPL13AP5-201ENST00000439189 CCDC125Q86Z20 511 aa17.89■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 CPDO75976 1380 aa17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 GLI3P10071 1580 aa17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 GCP02774 474 aa17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 NLRP6P59044 892 aa17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 TTC21AQ8NDW8 1320 aa17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 CHRNA2Q15822 529 aa17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 SSH2Q76I76 1423 aa17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 A0A0G2JS52 829 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 EVA1CP58658 441 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 MYT1Q01538 1121 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
RPL13AP5-201ENST00000439189 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 EP400Q96L91 3159 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 KCNH5Q8NCM2 988 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 TMC1Q8TDI8 760 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 STRN4Q9NRL3 753 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 TERF2IPQ9NYB0 399 aa17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 NINLQ9Y2I6 1382 aa17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 NRKQ7Z2Y5 1582 aa17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 NRAPQ86VF7 1730 aa17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 TESK2Q96S53 571 aa17.79■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 AATKQ6ZMQ8 1374 aa17.79■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 BARGINQ6ZT62 677 aa17.77■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
RPL13AP5-201ENST00000439189 SLIT3O75094 1523 aa17.77■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 TMF1P82094 1093 aa17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 USP47Q96K76 1375 aa17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 CDCA8Q53HL2 280 aa17.75■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.75■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 ARHGEF25Q86VW2 580 aa17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 USP31Q70CQ4 1352 aa17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 USP35Q9P2H5 1018 aa17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 PIK3C2AO00443 1686 aa17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 LMO7Q8WWI1 1683 aa17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 A0A1W2PP64 1363 aa17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 CRB1P82279 1406 aa17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 AKAP12Q02952 1782 aa17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP5-201ENST00000439189 PDE3BQ13370 1112 aa17.7■□□□□ 0.42
RPL13AP5-201ENST00000439189 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.7■□□□□ 0.42
RPL13AP5-201ENST00000439189 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP5-201ENST00000439189 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP5-201ENST00000439189 SOX12O15370 315 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms