RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433843.1

SNHG5-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 2

Gene SNHG5, Length 388 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-208	ENST00000433843	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	WFS1	O76024	890 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	QPCT	Q16769	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	MPND	Q8N594	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	LILRB3	O75022	631 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	BMP1	P13497	986 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG5-208	ENST00000433843	WIPF1	O43516	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	CTH	P32929	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	GRM5	P41594	1212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NNT	Q13423	1086 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NR3C2	P08235	984 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	TIMP2	P16035	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	ADH1C	P00326	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	VEGFB	P49765	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-208	ENST00000433843	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	TSC1	Q92574	1164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843		H3BM21	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	GMPR	P36959	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	NR5A1	Q13285	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	AGER	Q15109	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	NR6A1	Q15406	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	FSHR	P23945	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	SCARF1	Q14162	830 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	IRF7	Q92985	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-208	ENST00000433843	CBLB	Q13191	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG5-208	ENST00000433843		Q6ZVU0	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms