RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.23■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.22■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.21■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.2■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.2■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BTG4Q9NY30 223 aa28.2■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ACEP12821 1306 aa28.18■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.16■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.14■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.13■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.12■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIAA0232Q92628 1395 aa28.11■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.1■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.1■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.1■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.1■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.09■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CABP2Q9NPB3 220 aa28.08■■■□□ 2.09
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.07■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.05■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.05■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.04■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP19O94966 1318 aa28.04■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NEUROD1Q13562 356 aa28.04■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHRNA2Q15822 529 aa28.04■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABTB2Q8N961 1025 aa28.04■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.03■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 A0A0G2JS52 829 aa28.03■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYT1Q01538 1121 aa28.03■■■□□ 2.08
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CPDO75976 1380 aa28.01■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CABP1Q9NZU7 370 aa28■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP6P35125 1406 aa27.99■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EVC2Q86UK5 1308 aa27.98■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NLRP13Q86W25 1043 aa27.98■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.97■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STRN4Q9NRL3 753 aa27.96■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SSH2Q76I76 1423 aa27.95■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.95■■■□□ 2.07
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GCP02774 474 aa27.95■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EVA1CP58658 441 aa27.9■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BARGINQ6ZT62 677 aa27.9■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLIT3O75094 1523 aa27.89■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BAG6P46379 1132 aa27.89■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM182BQ5T319 152 aa27.89■■■□□ 2.06
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.89■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NLRP6P59044 892 aa27.88■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PIK3C2AO00443 1686 aa27.87■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.87■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AKAP12Q02952 1782 aa27.86■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP35Q9P2H5 1018 aa27.85■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.84■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.84■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DISP2A7MBM2 1401 aa27.84■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.82■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.82■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.81■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 COL18A1P39060 1754 aa27.79■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TONSLQ96HA7 1378 aa27.79■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.79■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CRB1P82279 1406 aa27.78■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PDE3BQ13370 1112 aa27.77■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.75■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.74■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRIM37O94972 964 aa27.74■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.74■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.74■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.72■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.71■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NFAT5O94916 1531 aa27.71■■■□□ 2.03
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.7■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.69■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRP5O75197 1615 aa27.68■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 USP31Q70CQ4 1352 aa27.68■■■□□ 2.02
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms