RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	ACE	P12821	1306 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	CABP2	Q9NPB3	220 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM83G	A6ND36	823 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CIZ1-209	ENST00000420484	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CIZ1-209	ENST00000420484	TONSL	Q96HA7	1378 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CIZ1-209	ENST00000420484	GLI3	P10071	1580 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CIZ1-209	ENST00000420484	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CIZ1-209	ENST00000420484	VPS72	Q15906	364 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CIZ1-209	ENST00000420484	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
CIZ1-209	ENST00000420484	EVC2	Q86UK5	1308 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CIZ1-209	ENST00000420484	NRAP	Q86VF7	1730 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	BTG4	Q9NY30	223 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	CABP1	Q9NZU7	370 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CIZ1-209	ENST00000420484	ABTB2	Q8N961	1025 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	KIAA0232	Q92628	1395 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CIZ1-209	ENST00000420484	USP6	P35125	1406 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	USP19	O94966	1318 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	NLRP13	Q86W25	1043 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CIZ1-209	ENST00000420484	CHRNA2	Q15822	529 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CIZ1-209	ENST00000420484	EP400	Q96L91	3159 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CIZ1-209	ENST00000420484	AKAP12	Q02952	1782 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CIZ1-209	ENST00000420484	SSH2	Q76I76	1423 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	GC	P02774	474 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	CPD	O75976	1380 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	PIK3C2A	O00443	1686 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	NLRP6	P59044	892 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC125	Q86Z20	511 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CIZ1-209	ENST00000420484	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484		A0A0G2JS52	829 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	MYT1	Q01538	1121 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	SLIT3	O75094	1523 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	42.01	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CIZ1-209	ENST00000420484	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		42	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	EVA1C	P58658	441 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		41.97	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	TESK2	Q96S53	571 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CIZ1-209	ENST00000420484	TMC1	Q8TDI8	760 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	41.94	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	USP35	Q9P2H5	1018 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	COL18A1	P39060	1754 aa		41.88	■■■■■ 4.3
CIZ1-209	ENST00000420484	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		41.86	■■■■■ 4.29
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC24A1	O60721	1099 aa		41.85	■■■■■ 4.29
CIZ1-209	ENST00000420484	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CIZ1-209	ENST00000420484	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	41.84	■■■■■ 4.29
CIZ1-209	ENST00000420484	USP47	Q96K76	1375 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM182B	Q5T319	152 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	USP54	Q70EL1	1684 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	SOX12	O15370	315 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	NFAT5	O94916	1531 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	USP31	Q70CQ4	1352 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484		A0A1W2PP64	1363 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	CRB1	P82279	1406 aa		41.78	■■■■■ 4.28
CIZ1-209	ENST00000420484	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28

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