RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 EPS15P42566 896 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 PRKAR2BP31323 418 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 CFTRP13569 1480 aa15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 WDR63Q8IWG1 891 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.69■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 FOSBP53539 338 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 38.5
TNS1-205ENST00000419504 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ANKRD1Q15327 319 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SDF4Q9BRK5 362 aa15.68■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ERBINQ96RT1 1412 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 NFKBIBQ15653 356 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ARAP1Q96P48 1450 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TXLNAP40222 546 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 PRAM1Q96QH2 718 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 MYO6Q9UM54 1294 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 FYB1O15117 783 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.67■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ODF2Q5BJF6 829 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 KINO60870 393 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SMARCE1Q969G3 411 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TSPY26PQ9H489 355 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TOP2BQ02880 1626 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.66■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 TIAM1Q13009 1591 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 SYNJ1O43426 1573 aa15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TNS1-205ENST00000419504 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 OFD1O75665 1012 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 JMYQ8N9B5 988 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 AFAP1Q8N556 730 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CDK19Q9BWU1 502 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 SPG7Q9UQ90 795 aa15.64■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 DAPK1P53355 1430 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 NEK4P51957 841 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 PDILTQ8N807 584 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 TRAK2O60296 914 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.63■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 ZNF428Q96B54 188 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 DACH1Q9UI36 760 aa15.62■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.5
TNS1-205ENST00000419504 CAGE1Q8TC20 777 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 MAP7D2Q96T17 732 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 SLC4A2P04920 1241 aa15.61■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 TRIM5Q9C035 493 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 HMGXB3Q12766 1538 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CABP4P57796 275 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 STK38Q15208 465 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TNS1-205ENST00000419504 SMC2O95347 1197 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms