RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 DACH1Q9UI36 760 aa8.86□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 PREX2Q70Z35 1606 aa8.86□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.86□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.85□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.85□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 PLCH2O75038 1416 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 NCOA1Q15788 1441 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 LCE2CQ5TA81 110 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.84□□□□□ -0.99
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PRR14Q9BWN1 585 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.83□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 AVPP01185 164 aa8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.82□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 KDM6BO15054 1643 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 TLL1O43897 1013 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.81□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 S1PR4O95977 384 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.8□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PDIA6Q15084 440 aa8.79□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.79□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.79□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ASXL2Q76L83 1435 aa8.79□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.78□□□□□ -1
C6orf48-208ENST00000395788 ABCC1P33527 1531 aa8.77□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.77□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 AXIN1O15169 862 aa8.77□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.77□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TSPY4P0CV99 314 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TSPY10P0CW01 314 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SLC4A3P48751 1232 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.76□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.75□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.75□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TTC13Q8NBP0 860 aa8.75□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.75□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 PZPP20742 1482 aa8.75□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 PLXNC1O60486 1568 aa8.74□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.74□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.74□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.74□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.73□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 KIF15Q9NS87 1388 aa8.73□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 FOXC1Q12948 553 aa8.73□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.72□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.72□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.72□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.72□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 FANCAO15360 1455 aa8.71□□□□□ -1.01
C6orf48-208ENST00000395788 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ADH1BP00325 375 aa8.71□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM52Q96A61 297 aa8.71□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.71□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.7□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ERBINQ96RT1 1412 aa8.7□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.7□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 GLI2P10070 1586 aa8.69□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.69□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 UNC13BO14795 1591 aa8.69□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 NEUROD1Q13562 356 aa8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 EYA1Q99502 592 aa8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 CD109Q6YHK3 1445 aa8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 NUP155O75694 1391 aa8.67□□□□□ -1.02
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRL1O94910 1474 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms