RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

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Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 PLEKHG5O94827 1062 aa4.91□□□□□ -1.62
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SNORD17-201ENST00000390930 PIK3C2AO00443 1686 aa4.91□□□□□ -1.62
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SNORD17-201ENST00000390930 COL18A1P39060 1754 aa4.88□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 EP400Q96L91 3159 aa4.87□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 RGS12O14924 1447 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 OVOS2Q6IE36 1432 aa4.86□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 SOX12O15370 315 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 SLC24A1O60721 1099 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.85□□□□□ -1.63
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SNORD17-201ENST00000390930 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 NSD3Q9BZ95 1437 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 AATKQ6ZMQ8 1374 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD17-201ENST00000390930 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.84□□□□□ -1.63
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